José Gallardo Matus
Gallardo Matus, José
Profesor Adjunto
jose.gallardo@pucv.cl
Biólogo Marino, Universidad Católica de la Santísima Concepción, Chile
Doctor en Ciencias, Mención Ecología y Biología Evolutiva, Universidad de Chile, Chile
Laboratorio de genética y genómica aplicada.
RESEÑA
El Dr. gallardo está interesado en todos los aspectos de la genética y la genómica y su uso en la acuicultura. Tras el exitoso secuenciamiento genómico de varias especies de interés para la acuicultura mundial, como el salmón del Atlántico y la trucha arcoiris, su principal objetivo de investigación es descifrar la información codificada dentro de los genomas y aplicar este conocimiento para mejorar la sostenibilidad de la acuicultura.
Actualmente, el Dr. Gallardo lidera un grupo de investigación interdisciplinario e internacional de profesionales que incluye biólogos marinos, bioquímicos, biotecnólogos, ingenieros agrícolas, acuicultures, veterinarios y matemáticos, con la misión de proporcionar alternativas de sostenibilidad a la industria acuícola global.
Si estás interesado en contribuir al desarrollo de la acuicultura a nivel mundial y ser parte de su equipo, o si buscas formación de alto nivel en genética y genómica aplicada a la acuicultura visita su página web o contacta con él directamente.
LINEAS DE INVESTIGACIÓN
1.- Selección y domesticación de organismos acuáticos:
En esta área trabajamos en el análisis genético y genómico de rasgos de importancia económica relacionados al crecimiento, a la calidad y al estrés por hipoxia, el cruzamiento consanguíneo y la gestión de la crianza, y la optimización de programas de mejora genética. Para ello diseñamos el DNA CHIP (SNP array), realizamos estudios de asociación genómica (GWAS, Genome-wide association study) utilizando el array BeadChip de Illumina y los arrays de genotipado Axiom de Thermofisher (Ex - Arrays de GeneChip de Affymetrix). También realizamos estudios de secuenciación de todo el genoma (WGS), análisis de la diversidad genética y la estructura de las poblaciones, y selección genética reproductiva.
2.- Resistencia genética a los patógenos de los peces: En esta área nos interesa evaluar diferentes rasgos cuantitativos de resistencia y tolerancia a los patógenos. Además, nos interesa comprender los mecanismos moleculares que explican esta respuesta defensiva de los hospederos contra sus patógenos. Para ello realizamos desafíos de infección controlada de patógenos, estudios de supervivencia, evaluación de la eficacia de las vacunas y análisis de expresión génica global (RNASeq, secuenciación de ARN). Además, regularmente utilizamos tecnologías de ADN recombinante clásicas y exploramos nuevas tecnologías como la epigenética y la edición genómica.
PUBLICACIONES DESTACADAS
Valenzuela-Aviles P, Torrealba D, Figueroa C, Mercado L, Dixon B, Conejeros P, Gallardo-Matus J. 2022. Why vaccines fail against Piscirickettsiosis in farmed salmon and trout and how to avoid it: A review. Front. Immunol. 13:1019404.
Figueroa, C.; Torrealba, D.; Morales-Lange, B.; Mercado, L.; Dixon, B.; Conejeros, P.; Silva, G.; Soto, C.; Gallardo, J.A. 2022. Commercial Vaccines Do Not Confer Protection against Two Genogroups of Piscirickettsia salmonis, LF-89 and EM-90, in Atlantic Salmon. Biology 11(7) 993.
Carolina Figueroa, Pamela Veloso, Lenin Espin, Brian Dixon, Débora Torrealba, Islam Said Elalfy, Juan Manuel Afonso, Carlos Soto, Pablo Conejeros & José A. Gallardo. 2020. Host genetic variation explains reduced protection of commercial vaccines against Piscirickettsia salmonis in Atlantic salmon. Scientific Report 10, 18252.
Carolina Figueroa, Paulina Bustos, Débora Torrealba, Brian Dixon, Carlos Soto, Pablo Conejeros & José A. Gallardo. 2017. Coinfection takes its toll: Sea lice override the protective effects of vaccination against a bacterial pathogen in Atlantic salmon. Scientific Reports 7: 17817
Lhorente JP, Gallardo JA, Villanueva B, Carabaño MJ, Neira R (2014) Disease Resistance in Atlantic Salmon (Salmo salar): Coinfection of the Intracellular Bacterial Pathogen Piscirickettsia salmonis and the Sea Louse Caligus rogercresseyi. PLoS ONE 9(4): e95397.
Neira R, Díaz N, Gall G, Gallardo JA, Lhorente JP, Manterola R (2006) Genetic improvement in Coho salmon (Oncorhynchus kisutch). I: Selection response and inbreeding depression on harvest weight. Aquaculture 257: 9-17.
Neira R, Diaz N, Gall G, Gallardo JA, Lhorente JP, Alert A (2006). Genetic improvement in Coho salmon (Oncorhynchus kisutch). II: Selection response on early spawning date. Aquaculture 257: 1-8.
Gallardo JA, Neira R (2005). Environmental dependence of inbreeding depression in cultured Coho salmon: aggressiveness, dominance and intraespecific competition. Heredity 95: 449-456.
Gallardo JA, Lhorente JP, García X, Neira R (2004) Effect of nonrandom mating schemes to delay the inbreeding accumulation in cultured populations of Coho salmon (Oncorhynchus kisutch). Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Science 61: 547-553.
Gallardo JA, García X, Lhorente JP, Neira R (2004) Inbreeding and inbreeding depression of female reproductive traits in two populations of Coho salmon selected using BLUP predictors of breeding values. Aquaculture 234: 111-122